Prof. Dr. Cüneyt KÖKSOY, Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi'nde başladığı lisans eğitimini 1987 yılında tamamlayarak tıp doktoru unvanı almıştır. 1993 yılında ise Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi Genel Cerrahi Anabilim Dalı'nda uzmanlık eğitimini almış ve Genel Cerrahi uzmanı olmuştur.
1998-2000 yılları arasında The Methodist Hospital, Baylor College of Medicine, Houston, Teksas'ta klinik fellow olarak Prof. Dr. Joseph S. Coselli'nin yanında aorta ve damar cerrahisi eğitimi almış olan Prof. Dr. Cüneyt KÖKSOY, 2004 yılında Avrupa Damar Cerrahisi Board (EBSQ-VASC) sınavını başarı ile geçmiştir. 2008 yılında Cleveland Clinic Damar Cerrahisi Departmanında Klinik Fellow olarak Endovasküler Cerrahi eğitimini başarıyla tamamlamıştır. Yine 2008 yılında Amerikan Damar Cerrahisi Derneği'nin (SVS) uluslararası ödülünü kazanarak ABD'de birçok merkezde araştırmalar yapmıştır. Ayrıca kensi halen ülkemizden SVS üyeliğine kabul edilmiş olan ilk ve tek damar cerrahı niteliğine sahiptir.
2008 yılında Profesör unvanı almış olan Prof. Dr. Cüneyt KÖKSOY'un uluslararası atıf indeksleri kapsamındaki dergilerde yayınlanmış 58 adet araştırma makalesi bulunmakta olup bu makalelere 900'ün üzerinde atıfta bulunulmuştur. Ayrıca ulusal ve uluslararası çok sayıda ödüle sahip olan Dr KÖKSOY, Türkiye Bilimler Akademisi Üstün Başarılı Genç Bilim İnsanlarını Ödüllendirme Programı (TÜBA-GEBİP) Bilim Bursuna layık görümüştür.
Prof.Dr. Cüneyt Köksoy hastalarını Çankaya'da yer alan muayenehanesinde kabul etmektedir.
