Prof Dr. Alper Gökçe lisans öncesi eğitimini tamamladıktan sonra, 1992 yılında İstanbul Tıp Fakültesi Tıp Fakültesinden mezun olup, 1997 yılında da Cerrahpaşa Tıp fakültesi, Ortopedi ve Travmatoloji AD İstanbul Üniversitesi'nden uzmanlığını almıştır. 2006 yılında Board Sertifikasyonu Türk Ortopedi ve Travmatoloji Yeterlilik sınavını (TOTEK) başarıyla tamamlamıştır.
1992-1997 yılları arasında İstanbul Üniversitesi, Cerrahpaşa Tıp Fakültesi, Ortopedi ve Travmatoloji AD. asistanlığını devam ettirirken eş zamanlı olarak 1994-1996 yıllarına El Cerrahisi Eğitimi İstanbul El ve Mikrocerrahi Merkezi tamamlamıştır. 1997-1999 Siirt'te 30 yataklı Seyyar Cerrahi Asker Hastanesi'nde, 1999-2003 sorumlu uzman olarak Medikal Park Hastanesi'nde ve 2003-2005 Ortopedi ve Travmatoloji Sorumlu Uzman olarak Özel Hayat Hastanesin'de göre yapmıştır.
Prof Dr. Alper Gökçe; 2005 – 2007 yıllarında Yard. Doç. Dr. unvanı ile Yeditepe Üniversitesi Tıp Fakültesi, Ortopedi ve Travmatoloji AD'de ardından yine aynı unvanla 2007-2008 Tekirdağ'da Namık Kemal Üniversitesi Tıp Fakültesi Ortopedi ve Travmatoloji Ana Bilim Dalın'da görev yapmıştır. 2008 yılından bu yana Namık Kemal Üniversitesi Tıp Fakültesi'nde Namık Kemal Üniversitesi Tıp Fakültesi'nde görevini sürdürmektedir.
Prof Dr. Alper Gökçe bugüne kadar bir çok ödüle layık görüldü. bunlardan bir kaçı şu şekildedir; 2008 yılında Türk Artroskopi Derneği'nin Veli Lök En İyi Klinik Çalışma Ödülü, 2012 yılında Omuz-Dirsek Cerrahisi Derneği'nin En iyi poster ödülü ve 2012 yılınında Türkiye Spor YaralanmalarıArtroskopi ve Diz Cerrahisi Derneği'nin Veli Lök En İyi Bilimsel Araştırma Ödülü'dür.
Aynı zamanda Prof Dr. Alper Gökçe'nin üyesi olduğu bir çok Dernek ve Kurumlar da bulunmaktadır. Cerrahpaşa Tıp. Fak. Ortopedi ve Travmatoloji Mezunları Derneği, IEL Mezunlar Derneği, Türk Ortopedi ve Travmatoloji Birliği Türk ortopedi ve Travmatoloji Derneği, Ayak ve Ayabileği Cerrahsi Derneği, Türk - Alman Sağlık Forumu, Artroplasti Derneği bunlardan bazılarıdır.
