Tüp bebekle elde edilen embriyolardan en iyi kalitede olanların transferi yapılır. Bu transfer işlemi, sayı ve gelişim durumuna göre 2-5. gün aralığındaki embryolarda yapılır. Genetik hastalıkların tanısı için genetik tanılama (PGD) yapılan embriyolar için 5. gün (blastokist) transferi yapılır.
İkiden fazla sayıda transfer, gebelik şansını artırmaz ama ikiz gebelik riskini artırır.
Embiyo transferi, 5 dakikada biten basit ve ağrısız bir işlem, anestezi gerektirmez. Hasta 1 saat istirahat sonrası evine gidebilir.
Embriyo transferinden sonra 12. gün gebelik testi (beta-hCG) yapılır. Test pozitif gelirse 2 gün sonra tekrarlanır ve artış izlenir bu dönemde ilaç kullanmaya devam edilir.
Gebelik testi negatifse tüm ilaçlar bırakılır ve adet beklenir.