Tüp bebek tedavisinde gebelik şansı en yüksek embriyoları seçebilmek maksadı ile genelde transfer edilecek embriyodan daha fazla sayıda embriyo geliştirilmektedir. Transfer edilmeyen ancak gebelik şansı yüksek olan ve iyi kalitede gelişim gösteren bu embriyolar dondurularak ileri bir dönemde kullanılabilmektedir. Böylelikle daha basit bir yöntemle çiftlerin yeni bir tüp bebek tedavisinin getireceği maddi ve tıbbi külfetleri azaltılabilmektedir.
Embriyolar dondurulma işlemine karşı oldukca hassas olup bazı embryolar çözülme işlemi esnasında canlıklarını yitirebilmektedir. Ancak dondurulma ve çözülme işleminden canlı olarak çıkan embryolardan oluşan gebeliklerin ve doğan çocukların gelişimi dondurulmamış embryolar gibi normal olup dondurma işlemine bağlı her hangi bir doğum arazı söz konusu değildir. Dondurulmuş embryoların gebelik şansı genelde dondurulmamış embryolardan daha az olduğu gözlenmiştir, ancak 'vitrifikasyon' olarak adlandırılan yeni bir hızlı dondurma yöntemi ile hem embriyoların canlılık oranları hemde gebelik şansları belirgin olarak artmıştır. Başarıyı belirleyen en önemli faktör embryoların transfer edildikleri değil donduruldukları andaki hanımın yaşıdır ve dondurulmamış embryoların aksine bu geçen zamanla azalmamaktadır.
Dondurulmuş embriyoların transferi için rahim iç yüzeyininin (endometrium) hazırlanması gerekmektedir. Bu hazırlık düzenli adet gören hanımlarda ilaç kullanımına gerek olmadan tamamen doğal adet döneminde yapılabileceği gibi adet düzensizliği olan hanımlarda 2 haftalık basit bir hormon tedavisi ile de sağlanabilmektedir, gebeliğin oluşması durumunda hormon tedavisi 3 ay kadar daha devam etmektedir. Her iki yönteminde başarı oranları aynıdır.
