Kolon kanseri tanısı kolonoskopide saptanan şüpheli dokudan alınan biyopsinin patolojik incelemesi ile konur.
Bazı durumlarda (nadir de olsa) alınan biyopsi materyalinde tümör tanısı için yeterince hücre bulunmayabilir veya biyopsiler kitlenin tümör dokusu içermeyen kısımlarına denk gelebilir. Böyle durumlarda gerekirse kolonoskopi ile biyopsi işlemi tekrarlanmalıdır.
Eğer kitle büyükse ve barsak tıkanıklığı belirtileri varsa veya ciddi kanamaya yol açıyorsa sorumlu hekimin önerileri doğrultusunda biyopsi alınmaksızın cerrahi işlem de düşünülebilir.